Разработка нового молекулярного анализа для типирования Streptococcus Pneumoniae

Abstract

Реферат. В настоящее время для серотипирования пневмококка используют серологические методы, традиционную полимеразную цепную реакцию (ПЦР) и полимеразную цепную реакцию в режиме реального времени (ПЦР-РВ), полногеномное секвенирование. Несмотря на то, что мультиплексная ПЦР имеет ряд ограничений, а подходы, основанные на полногеномном секвенировании, могут с высокой точностью предсказать почти все серотипы, определить сиквенс-типы, выявить гены антибиотикорезистентности и вирулентности, использование мультиплексной ПЦР-РВ более экономически обоснованно и удобно в клинической практике. За последние 10 лет в стране налажена система молекулярно-генетического мониторинга бактериальных инфекций, в том числе и определение серотипов возбудителей. Однако на данный момент не существует коммерческого набора реагентов для молекулярно-генетического типирования пневмококка. Метод может стать методологической основой для слежения за изменением серотипого пейзажа пневмококка, что важно на фоне внедрения рутинной иммунизации детей пневмококковыми вакцинами в Республике Беларусь.

Currently, serological methods, traditional polymerase chain reaction (PCR) and real-time polymerase chain reaction (PCR-RT), and whole-genome sequencing are used for pneumococcal serotyping. Despite the fact that multiplex PCR has a number of limitations, and approaches based on whole-genome sequencing can predict almost all serotypes with high accuracy, determine sequence types, and identify antibiotic resistance and virulence genes, the use of multiplex RT-PCR is more feasible, economically justified, and convenient in clinical practice. Over the past 10 years, a system of molecular genetic monitoring of bacterial infections has been established in the country, including the determination of pathogen serotypes. However, at the moment there is no commercial reagent kit for molecular genetic serotyping of pneumococcus. The developed method can become a methodological basis for monitoring changes in the serotype landscape of pneumococcus, which is important against the background of routine immunization of the population with pneumococcal vaccines.