IN SILICO скрининг взаимодействия гиперсиалированный гликанов опухолей с ингибиторными рецепторами иммунных клеток: сравнительный термодинамический анализ

Abstract

На выборке из 10 молекулярных систем (4 лиганда х 5 рецепторов) с использованием алгоритма AutoDock GPU показано, что рецепторы Siglec-9, LILRB1 и KIR2DL1 демонстрируют низкую аффинность или отсутствие связывания. Рецептор Siglec-8 проявил высокую селективность и аффинность к сиалированным лигандам. Установлено, что максимальная энергия связывания достигается в комплексах Siglec-8 с полисиаловой кислотой (PSA, ΔG = -9.68 ккал/моль) и дисиалоганглиозидом GD2 (ΔG = -7.26 ккал/моль). Полученные данные статистически достоверно выделяют Siglec-8 как ключевой рецептор, потенциально участвующий в распознавании гликанового профиля опухоли.

Using a sample of 10 molecular systems (4 ligands x 5 receptors), the AutoDock GPU algorithm showed that the receptors Siglec-9, LILRB1, and KIR2DL1 exhibit low affinity or no binding. Siglec-8 receptor exhibited high selectivity and affinity for sialylated ligands. It was found that the maximum binding energy was achieved in complexes of Siglec-8 with polysialic acid (PSA, ΔG = -9.68 kcal/mol) and disialoganglioside GD2 (ΔG = -7.26 kkal/mol). Results attributed Siglec-8 as a key receptor potentially involved in the recognition of the tumor glycan profile.