Оценка влияния аминокислотных замен на стабильность эпидермального фактора роста человека и его средство к рецептору с целью разработки нового препарата для лечения синдрома диабетической стопы

Abstract

В статье проведён in silico анализ стабильности эпидермального фактора роста человека (далее — ЭФРЧ). Выявлены два участка с высоким амилоидогенным потенциалом. Посредством алгоритмов PentaFold 3.0, PentUnFOLD, mCsM-PPI2 и молекулярного докинга установлено, что аминокислотные замены M21R и K48R повышают аффинность ЭФРЧ к его рецептору, увеличивают внутреннюю нестабильность белка и не усиливают его склонность к амилоидообразованию. Связывание мутантных форм белка с рецептором происходит в том же сайте, что и у нативного белка.

In this article the in silico analysis of human epidermal growth factor (hEGF) stability was performed, and mutagenesis of its amyloidogenic fragments was carried out. Two regions with high amyloidogenic potential were identified. Using PentaFold 3.0, PentUnFOLD, mCSM-PPI2 algorithms and molecular docking was established that amino acid substitutions M21R and K48R increase affinity of hEGF to receptor, enhance intrinsic protein instability and do not increase its propensity for amyloid formation. Mutant forms of hEGF have the same binding site with receptor as the native protein.