Вторичная структура белка-предшественника бета-амилоидных пептидов в районе сайта связывания с бета-секретазой по результатам работы алгоритма PentaFOLD 3.0

Abstract

Поиск эффективных препаратов для борьбы с болезнью Альцгеймера на данный момент не увенчался успехом. Основным этапом в патогенезе этого заболевания считается преимущественный протеолиз белка-предшественника амилоидных пептидов в его надмембранной части с помощью бета-секретазы, в отличие от альфа-секретазы, фрагментирующей в области вблизи внешней поверхности мембраны (неамилоидогенный путь протеолиза). Гамма-секретаза «разрезает» тот же белок в трансмембранной части. Образующиеся в результате амилоидогенного протеолиза бета-амилоидные пептиды, содержащие гидрофобный фрагмент трансмембранного домена, агрегируют за счёт формирования межмолекулярной бета-структуры. Если структурные исследования амилоидных пептидов весьма многочисленны, но неоднозначны, то вторичная структура сайта связывания белка-предшественника с бета-секретазой до сих пор неизвестна.