Методика определения гена 16S рРНК бактерий в изучении респираторного микробиома

Abstract

В исследовании была поставлена цель изучить возможности методики определения гена 16S рРНК бактерий в определении бактериального спектра обострения хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ). Проспективно оценены 68 госпитализированных пациентов с обострением ХОБЛ. Использовалось молекулярно-генетическое определение гена 16S рРНК бактерий и культуральные микробиологические методики из материала бронхиального дерева, полученного при защищенной браш-биопсии и рутинные микробиологические исследования мокроты. Бактериальные агенты были выявлены в 91,2 % случаев обострения ХОБЛ. Так, Pseudomonas aeruginosa выявлялась в биопсийном материале в 1,8 раза чаще, чем при использовании рутинных методик.Определены паттерны течения ХОБЛ с частыми обострениями, инфекционного обострения и псевдомонадной этиологии обострения. Использование методики молекулярно-генетического определения гена 16S рРНК позволяет верифицировать бактериальный спектр обострения ХОБЛ.

The study set a goal to the possibilities of the method of determining the 16S rRNA gene of bacteria in the determination of the bacterial spectrum of acute exacerbation of chronic obstructive pulmonary disease (COPD) using a protected material sampling 68 Hospitalized patients with acute exacerbation of COPD were prospectively evaluated. Molecular genetic determination of the 16S rRNA gene of bacteria and cultural microbiological techniques from sputum and a bronchial tree material obtained using a protected brush biopsy were used. Bacterial agents were detected in 91,2 % of cases of acute exacerbation of COPD. Pseudomonas aeruginosa was detected in the biopsy material 1.8 times more often than with the use of routine methods. Patterns of COPD with frequent exacerbations, infectious exacerbations and Pseudomonas etiology of exacerbations were determined. Using the method of molecular-genetic determination of the 16S rRNA gene allows to verify the bacterial spectrum of acute exacerbation of COPD.