Особенности койла, способного к структурному переходу в полностью неупорядоченное состояние

Abstract

В данной статье рассмотрены особенности аминокислотного и пентапептидного состава стабильного койла, койла, способного к переходу в полностью неупорядоченное состояние и полностью неупорядоченного состояния белка. Показано, что данные элементы вторичной структуры имеют ряд достоверных отличий. Внутренне неупорядоченные фрагменты белков обогащены глицином, аланином, аспарагиновой кислотой и лизином по сравнению со стабильным койлом и койлом, способным к структурному переходу во внутренне неупорядоченное состояние. Также выявлены конкретные пентапептиды, детерминирующие внутренне неупорядоченное состояние белка: WOOWW, WWOOW, WWOWW, WOOWO, OWOOW.

In this article the features of the amino acid and pentapeptide content of stable random coil, random coil capable to structural transition to a completely disordered state and a completely disordered state of protein are described. It is shown that these elements of the secondary structure have a number of significant differences. Disordered protein fragments are enriched with glycine, alanine, aspartic acid and lysine compared to stable random coil and random coil capable to structural transition to a completely disordered state. Specific pentapeptides determining the completely disordered state of the protein have also been identified: WOOWW, WWOOW, WWOWW, WOOWO, OWOOW.