Оценка влияния аминокислотных замен на стабильность эпидермального фактора роста человека

Abstract

Аннотация. В данной статье проанализировано влияние 437 аминокислотных замен на стабильность вторичной структуры эпидермального фактора роста человека (ЭФРЧ) и на способность ЭФРЧ к структурным переходам с помощью оригинального алгоритма PentUnFOLD. В ходе проведенных in silico экспериментов были отобраны аминокислотные замены M21R и M21K, которые вызывают появление IDPRs в ЭФРЧ. Появление IDPRs должно способствовать лучшему взаимодействию белка с его рецептором, что подтверждается термодинамическими расчётами.

In this article we have analyzed the effect of 437 amino acid substitutions on the stability of the secondary structure of human epidermal growth factor (human EGF) and on the ability of human EGF to structural shifts using the original PentUnFOLD algorithm. As the results of the conducted in silico experiments the amino acid substitutions M21R and M21K were selected, which cause the appearance of IDPRs in human EGF. The appearance of IDPRs should contribute to a better interaction of the protein with its receptor, which is also confirmed by thermodynamic calculations.