Изучение аффинности in silico компонентов листьев ольхи черной и серой к целевым биологическим мишеням в рамках рационального DRUG-дизайна новых противоязвенных и противовоспалительных средств

Abstract

Проведен молекулярный докинг природных и синтетических соединений с двумя биологическими мишенями: циклооксигеназой-1 (ЦОГ-1), связанной с воспалительными процессами, и H⁺/K⁺-АТФазой, участвующей в развитии язвенной болезни. В качестве лигандов использованы активные компоненты экстрактов ольхи черной и серой (Alnus glutinosa and Alnus incana) – флавоноиды и кумарины, в частности гиперозид и кверцетин, а также референтные соединения: ацетилсалициловая кислота, диклофенак и омепразол. Эксперимент включал подготовку структур в AutoDock Tools, докинг с помощью AutoDock Vina и анализ взаимодействий в среде Schrodinger Maestro. Результаты показали, что гиперозид и кверцетин обладают высокой аффинностью как к ЦОГ-1, так и к H⁺/K⁺-АТФазе, что делает их перспективными кандидатами для создания растительных противовоспалительных и противоязвенных препаратов. Полученные данные свидетельствуют о целесообразности дальнейших фармакологических и технологических исследований с участием экстрактов ольхи как многофункциональных терапевтических агентов.

This study involved molecular docking of natural and synthetic compounds with two biological targets: cyclooxygenase-1 (COX-1), associated with inflammatory processes, and H⁺/K⁺-ATPase, involved in the development of peptic ulcer disease. The models used included active components of black and grey alder (Alnus glutinosa and Alnus incana) extracts–flavonoids and coumarins, particularly hyperoside and quercetin, as well as reference compounds: aspirin, diclofenac, and omeprazole. The methodology included structure preparation in AutoDock Tools, docking using AutoDock Vina, and interaction analysis in Schrodinger Maestro. The results demonstrated that hyperoside and quercetin exhibit high affinity for both COX-1 and H⁺/K⁺-ATPase, making them promising candidates for the development of plant-based anti-inflammatory and anti-ulcer drugs. The obtained data support the feasibility of further pharmacological and technological studies involving alder extracts as multifunctional therapeutic agents.