Дизайн in silico и оценка аффинности новых производных 6-тиодезоксигуанозина к активному центру теломеразы

Abstract

В данной статье рассмотрен активный центр теломеразы, а также ee взаимодействие с субстратом 5’-трифосфатом 6-тиодезоксигуанозинa. Авторами были предложены структурные аналоги 6-тиодезоксигуанозина и проведенno моделирование их молекулярныx контактов с теломеразой для оценки стабильности комплексов белок-лиганд. Для сравнения энергии взаимодействия использовали результаты докинга 6-тиодезоксигуанозина. По результатам исследования наибольшую аффинность к теломеразе имели производные, содержащие полярные заместители на С 2 аминогруппе пуринового кольца, которые характеризуются делокализацией электронной плотности и М-эффектом.

This article examines the active site of telomerase and its interactions with 5’-triphosphate of 6-thio-2’-deoxyguanosine (6S-dG). The authors introduced structural analogs of 6-S-dG and performed molecular docking with the active catalytic site of telomerase to assess the stability of protein-ligand complexes. The results of 6S-dG redocking were used as a reference. The study revealed that derivatives containing polar substituents at the C 2 amino group of the purine ring, which characterized by delocalization of electron density and the M-effect, exhibited the highest affinity to telomerase.