Прогнозирование протеолитической деградации коллагена типов I-III in silico

Abstract

Изучение протеолитической деградации белков соединительной ткани на примере коллагена осуществляют доступными экспериментальными методами определения гидроксилированных аминокислотных остатков пролина и лизина в свободном и связанном состоянии. Применение ферментативных методов в лабораторной практике ограничено, в связи с использованием дорогостоящих синтетических пептидных субстратов. Используя алгоритмы специфического гидролитического расщепления белковых субстратов in silico можно с высокой долей вероятности прогнозировать качественный состав пептидных продуктов при нарушении обмена соединительной ткани.