Распределение плотности кодирующих участков в геноме Fowlpox вируса и других Авипоксвирусов

Abstract

Анализ полногеномных последовательностей штаммов Fowlpox вируса и близких ему представителей рода Avipoxvirus показал, что для них характерно симметричное мутационное АТ-давление и особое распределение плотности генов (более высокая на 3’-конце «плюс» цепи и на 3’-конце «минус» цепи). В итоге выдвинута гипотеза о изначальном положении точки начала репликации в середине генома вируса с последующим её перемещением в терминальный повтор.

Analysis of the Fowlpox virus whole genome sequences and other Avipoxvirus species showed that there is symmetrical mutational AT-pressure and a special distribution of gene density (higher density is found on 3’-end of the plus strand and on 3’-end of the complementary strand). А hy-pothesis about the initial position of the origin of replication in the center of viral genome and its sub-sequent movement to the terminal repeats was developed.