Алгоритм видовой дифференциации возбудителей рода Bordetella и результаты его использования в Республике Беларусь

Abstract

Проведена видовая дифференциация возбудителей рода Bordetella в носоглоточных мазках пациентов с подозрением на коклюш с использованием разработанных нами ПЦР в реальном времени: дуплексной TaqMan ПЦР, направленной на выявление B. pertussis и B. parapertussis, с праймерами к мишеням IS481, IS1001, BP0026 и GAPDH гена человека, и двух моноплексных TaqMan ПЦР, направленных на выявление B. holmesii и B. bronchiseptica c праймерами к мишеням hIS1001 и flaA. При исследовании 3130 носоглоточных мазков B. pertussis, B. parapertussisи B. holmesii были выявлены в 29,5 %, 0,9 % и 0,4 % образцов соответственно. Разработанный алгоритм на основе трех TaqMan ПЦР оказался полезным инструментом в молекулярной диагностике коклюша. Его использование позволило установить коциркуляцию разных видов рода Bordetella, доминирование в циркуляции B. pertussis, низкий уровень циркуляции B. parapertussis, B. holmesii и отсутствие в циркуляции B. bronchiseptica в Республике Беларусь.