Нахождение неканонических мотивов в митохондриальной днк методами биоинформатики с применением пакета GQUAD для программного окружения R

Abstract

Аннотация. В статье описан подход к изучению структуры митохондриальной ДНК со скользящими нитями с помощью пакета gquad. Обнаружены 63 последовательности, которые могут быть чувствительными к мутагенезу, приводящему к развитию ряда митохондриальных патологий. Данный метод применим для оценки как митохондриального, так и ядерного генома, что может быть использовано в митохондриальной медицине.

Annotation. The article describes the approach to studying the structure of mitochondrial DNA with sliding strands using the gquad package. 63 sequences were detected, which may be sensitive to mutagenesis leading to the development of a number of mitochondrial pathologies. This method is applicable to the evaluation of both mitochondrial and nuclear genome, which can be used in mitochondrial medicine.