Изменения микробного пейзажа глотки в постковидный период

Abstract

Введение. Микробный пейзаж глотки и его изменения в период пандемии COVID-19 имеет большое прикладное и научное значение. Цель. Определить микробный пейзаж у пациентов фарингитами в период пандемии новой коронавирусной инфекции COVID-19 и динамику антибиотикорезистентности наиболее часто встречаемых видов микроорганизмов в сравнении с «доковидным» периодом. Материалы и методы. Проведен анализ 403 образцов отделяемого из глотки у пациентов, обратившихся к врачу-оториноларингологу с фарингитом. Основную группу составили 308 проб пациентов в период пандемии COVID-19 (2020–2022 г.). Группу сравнения составили 95 проб, забранных в 2019 году. Результаты. У пациентов с фарингитом в период пандемии COVID-19 по сравнению с «доковидным» периодом выявлены особенности микробного пейзажа глотки: частота встречаемости грамположительной флоры, преимущественно S. aureus, уменьшилась в 2 раза, что обратно пропорционально росту грибковой ко-инфекции, вызванной Candida spp, p < 0,05. Получен незначительный подъем частоты встречаемости Kl. pneumonie до 18 % в 2020 году. Выделение Enterococcus spp., наоборот, имело медленный, но устойчивый тренд к увеличению частоты выделения за все время наблюдения от 5 % в 2019 году к 12 % в 2022 году, что может указывать на развитие дисбиоза глотки, возникающего на фоне лечения инфекции COVID-19, p > 0,05.Выявлен рост антибиотикорезистентности к полусинтетическим пенициллинам S.aureus (с 4 % до 12–30 % (p < 0,05) и Klebsiella pneumoniae с 33 % в 2019 г. до 54 % в 2021 году (p < 0,05), с последующим снижением до 28 % в 2022 году. Также возросла антибиотикорезистентность Klebsiella pneumoniae к фторхинолонам с 25 % в 2019 году до 40 % в 2021 году (p < 0,05).

Introduction. The microbial landscape of a pharynx at the period of COVID-19 pandemic, compared to the pre-Covid period, have a great practical and scientific importance.Purpose. We determine the microbial landscape in patients with pharyngitis during the pandemic of the new coronavirus infection COVID-19 and the dynamics of antibiotic resistance of the most common types of microorganisms in comparison with the “pre-Covid” period. Materials and methods. We estimated 403 samples of throat culture from patients with pharyngitis. The main group consists of 308 samples from patients during the COVID-19 pandemic (2020–2022 years). The comparison group consists of 95 samples taken in 2019 year.Results. We reveal the following features of throat culture: Gram-positive flora, mainly S. aureus, decreases by 2 times, and Candida spp. increases by 2 times in patients with pharyngitis during the COVID-19 pandemic, compared with the pre-Covid period, p < 0.05. Kl. pneumonia slightly increases up to 18 % in 2020. Enterococcus spp.,on the contrary, had a slow but steady trend towards an increase from 5 % in 2019 to 12 % in 2022 (p > 0.05), which may indicate the development of pharyngeal dysbiosis that occurs during treatment of COVID-19 infection. Throat culture bacteria increase resistance to semisynthetic penicillins: S. aureusrom 4 % to 12–30 % (p < 0.05), Klebsiella pneumoniae from 33 % in 2019 to 54 %in 2021 (p < 0.05), with a subsequent decrease to 28 % in 2022. Klebsiella pneumoniae also increases resistance to fluoroquinolones from 25 % in 2019 to 40 % in 2021 (p < 0.05).