Устойчивость к антибиотикам и их комбинациям карбапенемазопродуцирующих штаммов Klebsiella pneumoniae, выделенных от пациентов с COVID-19

Abstract

Цель. Оценить чувствительность к антибиотикам и их комбинациям продуцирующих карбапенемазы клинических изолятов Klebsiella pneumoniae, выделенных от пациентов с бактериальными осложнениями COVID-19. Материалы и методы. Для 70 клинических изолятов K. рneumoniae, выделенных от пациентов с бактериальными осложнениями COVID-19 в 2021–2022 гг., методом ПЦР в реальном времени выполнена детекция генов карбапенемаз. Методом микроразведений в бульоне определены минимальные подавляющие концентрации антибиотиков (амикацина, колистина, тигециклина, меропенема). Определение чувствительности к двойным и тройным комбинациям антибиотиков выполнено модифицированным методом тестирования бактерицидности различных комбинаций. Результаты. Устойчивость к амикацину выявлена у 75,7% штаммов K. pneumoniae (МПК50 и МПК90 ≥1024 мг/л), к меропенему – у 91,4% (МПК50 – 64 мг/л, МПК90 – 256 мг/л), к колистину – у 90,0% (МПК50 – 32 мг/л, МПК90 ≥256 мг/л), к тигециклину – у 40,0% (МПК50 – 0,5 мг/л, МПК90 – 1 мг/л). Продуцентами карбапенемазы NDM являлись 4,3% штаммов, OXA-48 – 52,5%, копродуцентами NDM + OXA-48 – 35,7%, OXA-48 + KPC – 2,9%, NDM + OXA-48 + KPC – 4,3%. Среди протестированных комбинаций антибиотиков наиболее эффективной была тигециклин-колистин (бактерицидный эффект в отношении 52,9% штаммов, бактериостатический – 44,3% штаммов). Другие комбинации с включением колистина были активны в отношении 47,1–65,7% штаммов. Комбинации из двух карбапенемов не проявляли бактерицидной активности в отношении карбапенеморезистентных штаммов. Заключение. Выявленные высокие уровни резистентности к эмпирически назначаемым антибиотикам и их комбинациям требуют более широкого внедрения в рутинную практическую деятельность микробиологических лабораторий методов определения значений минимальных подавляющих концентраций и выявления синергидной активности комбинаций из нескольких антибиотиков.

Purpose. To assess susceptibility to antibiotics and their combinations of carbapenemaseproducing Klebsiella pneumoniae clinical strains isolated from patients with COVID-19 bacterial co-infections. Materials and methods. Carbapenemase genes were detected by real-time PCR in 70 K. pneumoniae strains isolated from patients COVID-19 with bacterial co-infections in 2021–2022. The MICs for antibiotics (amikacin, colistin, tigecycline, meropenem) were determined using the broth microdilution method. Susceptibility to double and triple antibiotic combinations was assessed by modified multiple combination bactericidal testing. Results. Resistance to amikacin was detected in 75.7% of K. pneumoniae strains (MIC50 and MIC90 ≥1024 mg/l), to meropenem in 91.4% (MIC50 – 64 mg/l, MIC90 – 256 mg/l), to colistin in 90.0% (MIC50 – 32 mg/l, MIC90 ≥256 mg/l), to tigecycline in 40.0% (MIC50 – 0.5 mg/l, MIC90 – 1 mg/l). Among the isolated strains, 4.3% were producers of NDM carbapenemase 52.5% of OXA-48, 35.7% were co-producers of NDM + OXA-48, 2.9% of OXA-48 + KPC, and 4.3% of NDM + OXA-48 + KPC. The tigecycline-colistin combination was rated the most effective (bactericidal effect against 52.9% of strains, bacteriostatic effect in 44.3%). Other colistin-based combinations have shown bactericidal effect against 47.1–65.7% of strains. Combinations of two carbapenems weren’t active against carbapenem-resistant strains. Conclusion. High levels of resistance to empirically prescribed antibiotics and their combinations were revealed, requiring a wider introduction of MICs determination methods and the identification of synergistic activity of antibiotic combinations into the routine practice of microbiological laboratories.